Клиническая база Медицинской академии последипломного образования (МАПО) включает отделение сердечно-сосудистой хирургии, пластической и эстетической хирургии, два хирургических отделения, в которых на самом современном уровне проводятся оперативные вмешательства на органах брюшной полости и эндокринных железах с использованием эндовидеохирургии, а также два терапевтических и два неврологических отделения. Терапевтическая и хирургическая клиники располагают палатами повышенной комфортности современного дизайна. Открывшиеся после реконструкции 4 операционные в полной мере отвечают уровню зарубежных хирургических центров. Диагностический уровень определяют широкий перечень лабораторных и инструментальных методов, проводимых на медицинской аппаратуре последнего поколения.

Преобразившиеся за последние годы после реконструкции клиники МАПО смогли расширить диапазон медицинских услуг населению нашего города и других регионов страны. Сегодня на отделении сердечно-сосудистой хирургии проводятся операции на клапанах сердца и коронарных артериях, в том числе аорто-коронарное шунтирование,

магистральных сосудах, а также осуществляется оперативное лечение нарушений ритма сердца с применением искусственных водителей ритма.

Высокий профессиональный уровень хирургов отделения пластической и эстетической хирургии позволил проводить операции: эндопротезирование молочных желез, омоложение лица и шеи и многие другие. Трудно переоценить значение хирургический методов лечения заболеваний печени, желудочно-кишечного тракта, а также щитовидной железы, надпочечников и поджелудочной железы, проводимых на отделениях хирургической клиники. Терапевтические отделения принимают на лечение пациентов с различными заболеваниями внутренних органов. Разработанные и внедренные в клиническую практику инновационные методы позволяют на самом современном уровне оказывать помощь больным с заболеваниями сердечно- сосудистой системы, опорно-двигательного аппарата, прежде всего ревматическими формами патологии суставов, а также иммунодефицитными состояниями.

Неврологическая клиника имеет многолетний опыт лечения заболеваний центральной нервной системы и периферических нервов, миопатий и др. Следует отметить, что определяющую роль в лечебно-диагностической работе основной клинической базы играет профессорско-преподавательский состав Академии. Руководят клиниками ведущие специалисты, такие как профессора А.Е.Борисов (хирургическая клиника), В.И.Мазуров (терапевтическая клиника), Ю.А.Шнейдер (сердечно-сосудистая хирургия), Н.А.Жулев (неврологическая клиника), С.Ф.Малахов (пластическая и эстетическая хирургия) и др.

Важная роль в клинической работе отводится отделению анестезиологии и реаниматологии, возглавляемому проф. С.В.Оболенским и доцентами имеющими большой опыт работы по обеспечению операций и оказанию интенсивной помощи больным с различными заболеваниями внутренних органов.